- 2002: The Andrew Elias Human Tolerance Award
- 2003: Kardinal-König-Preis
- 2010: Romano-Guardini-Preis
- 2011: Geduld mit Gott wurde als bestes theologisches Buch von der Europäischen Gesellschaft für Katholische Theologie ausgezeichnet
- 2014: Templeton-Preis (Auszug aus der Dankesrede Tomáš Halík zur Preisverleihung)
- 2014: Ehrendoktorwürde der Universität Erfurt
- 2016: Ehrendoktorwürde der Oxford Universität
- 2017: Per Artem Ad Deum („durch Kunst zu Gott“), verliehen durch den Päpstlichen Rat für die Kultur
- 2019: Bundesverdienstkreuz 1. Klasse für seine Verdienste um die deutsch-tschechische Versöhnung, den interreligiösen und internationalen Dialog
Auszeichnungen
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